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◎山形大学/工学部/応用生命システム工学科/応用生命工学講座


木ノ内 誠(KINOUCHI Makoto)
   1971年生 /講師 【バイオインフォマティクス, ソフトコンピューティング】
連絡先:電話0238-26-3363 FAX 0238-26-3363 E-Mail:kinouchi@ieee.org
教育研究活動
○研究テーマ: 自己組織化マップを用いた遺伝子の解析, DNA配列からのtRNA遺伝子の検出, DNA塩基配列の周期性解析
○主な授業科目: 遺伝子情報論, バイオインフォマティクス, 専門英語I, プログラミング演習I, プログラミング演習II
○学会・社会活動等: IEEE, 日本バイオインフォマティクス学会, 日本化学会

研究業績
ゲノムからみた生物の多様性と進化(共著),シュプリンガー・フェアラーク東京(2003)
Complex-Valued Neural Networks: Theories and Applications(共著),World Scientific Publishing(2003)
ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 〜生物情報の解析と応用〜(共著),エヌ・ティー・エス(2004)
Learning temporal sequences using complex neurons with local feedback(共著),Proc. IEEE Int. Conf. Neural Networks(1995)
Memorization of melodies by complex-valued recurrent network(共著),Proc. IEEE Int. Conf. Neural Networks(1996)
複素ニューロンによる時系列の学習(共著),電気学会論文誌, 116-C(1996)
Recurrent neural network using mixture of experts for time series processing(共著),Proc. IEEE Int. Conf. Syst., Man, and Cybern.(1997)
複素リカレントニューラルネットワークを用いたメロディの記憶と想起(共著),情報処理学会論文誌, 39(1998)
Music information retrieval system using complex-valued necurrent neural networks(共著),Proc. IEEE Int. Conf. Syst., Man, and Cybern.(1998)
Image segmentation by artificial life approach using autonomous agents(共著),Proc. Int. J. Conf. Neural Networks(1999)
Gene classification method based on batch-learning SOM(共著),Genome Informatics, 10(1999)
人工生命的手法による画像の領域分割(共著),日本ファジィ学会誌, 12(2000)
Proteome analysis of Oncorhynchus species during embryogenesis(共著),Electrophoresis 2000, 21(2000)
Prediction of proteolytic process based on N-terminal sequences and molecular weights by proteomics and proteome analysis(共著),J. Computer Aided Chem., 1(2000)
Detection of transfer RNA based on the cloverleaf secondary structure(共著),J. Computer Aided Chem., 1(2000)
Detection of tRNA based on the cloverleaf secondary structure(共著),Genome Informatics, 11(2000)
Statistical analysis of genomic information --Long-range correlation in DNA sequences--(共著),Genome Informatics, 11(2000)
ゲノム情報処理技術に基づいた生物種固有のコドン使用多様性(共著),情報知識学会誌, 10(2001)
Self-organizing mapping in codon usage diversity of bacterial genes(共著),Proc. J. Sympo. Bio-Sensing and Bio-Imaging(2001)
Detection of endocrine-disrupting activity for environmental materials by Salmonids(共著),Proc. J. Sympo. Bio-Sensing and Bio-Imaging(2001)
Codon usage and tRNA genes in eukaryotes: Correlation of codon usage diversity with translation efficientcy and with CG-dinucleotide usage as assess by multivariate analysis(共著),J. Mol. Evol., 53(2001)
Analysis of codon usage diversity of bacterial genes with a self-organizing map: characterization of horizontally transferred genes with emphasis on E. coli O157 genome(共著),Gene, 276(2001)
Detection of tRNA genes with introns from DNA sequences of Archaea(共著),Genome Informatics, 12(2001)
Statistical analysis of genomic information: various periodicities in DNA sequence(共著),Genome Informatics, 12(2001)
Periodicity in prokaryotic and eukaryotic genomes identified by power spectrum analysis(共著),Gene, 300(2002)
Quick learning for batch-learning self-organizing map(共著),Genome Informatics, 13(2002)
A novel bioinformatic strategy for unveiling hidden genome signatures of eukaryotes: self-organizing map of oligonucleotide frequency(共著),Genome Informatics, 13(2002)
Informatics for unveiling hidden genome signatures(共著),Genome Research, 13(2003)
Much faster learning algorithm for Batch-Learning SOM and its application to Bioinformatics(共著),Proc. Workshop on Self-Organizing Maps(2003)
Introduction of virtual peptides as absolute indices in SOM for usage in bioinformatics(共著),Proc. Workshop on Self-Organizing Maps(2003)
ゲノムDNA配列に潜んでいる生物種の個性を明らかにする新規な統計数理的手法(共著),統計数理, 52(2004)
Detection of tRNA genes from DNA sequences of eukaryotes(共著),The Fifteenth International Conference on Genome Informatics(2004)
URL
http://ei4web.yz.yamagata-u.ac.jp/~kinouchi/